Chiến đấu với Kẻ xâm lược ngoài hành tinh thoạt đầu có vẻ tàn bạo (tổn thất quân sự nặng nề theo tiêu chuẩn), điều này củng cố nhu cầu về đơn vị đặc biệt, và lúc đầu rất thú vị nhưng nhanh chóng trở nên lặp đi lặp lại. Yoshika Miyafuji hiện đã mất đi năng lực phù thủy và đang theo học để trở thành bác sĩ tại phòng khám gia đình, được đề nghị nhận học bổng quân sự để đi du học. Shizuka Hattori, một tân binh của phù thủy Fuso có nhiệm vụ hộ tống cô. Trong khi đó, một loại Neuroi mới xuất hiện và chứng tỏ là một thách thức xứng đáng đối với khả năng chiến đấu của các phù thủy.