Thiếu Lâm Tự Truyền Kỳ 3: Thiếu Lâm Tự Đại Mạc Anh Hào - The Legend of Shaolin Kung Fu 3 tiếp tục là câu chuyện kể về các cao tăng thiếu lâm, những môn võ bị thất truyền, sự đối đầu giữa các môn phái với nhau. Phần phim này lấy bối cảnh ở sa mạc Gôbi nơi đầy nắng gió và cát nóng, các cao tăng Thiếu Lâm có những nhiệm vụ vô cùng quan trọng, rèn luyện tu dưỡng võ thuật để chuẩn bị tiếp ứng với các cao thủ đồng đạo đến từ Trung nguyên.